Центральная достопримечательность Ярославля - церковь Ильи Пророка, построена в 1647-50 годах местными мастерами на средства местных же купцов братьев Скрипиных. Храм возведен на месте двух деревянных церквей – Ильи Пророка и Покрова Богоматери. Известно, что по завершении строительства патриарх Иосиф одарил купцов частицей ризы Христа из Успенского собора Москвы в знак особого расположения. Ризоположенческий придел храма как раз обязан этому очень значимому по тем временам событию – его пристроили в честь получения святыни.
Особенностью этого памятника архитектуры Ярославля является то, что во время большого пожара города в 1658 году церковь практически не пострадала, лишь утратила наружные росписи. Главы церкви Ильи Пророка после постройки храма имели чешуйчатое покрытие, впоследствии замененное на крашеное железо. В ходе реставрационных работ 1950-60-х годов покрытие было восстановлено, и сейчас купола выглядят так же, как и в 17 столетии. Для написания икон в храм Скрипиными был приглашен Федор Зубов, писавший иконы для Успенского собора Московского Кремля, «жалованный» царский иконописец. Внутренняя роспись храма – фрески - была создана после пожара в 1680-х годах костромскими художниками Гурием Никитиным и Силой Савиным. Скрипины к этому времени умерли, и средства на внутреннюю отделку давала уже их сестра, Улита (по некоторым источникам, вдова одного из братьев). Фески неоднократно подновлялись, в 1830 году свод и стены храма были прописаны темперными красками иконописцем Василием Сарафанниковым. Пять иконостасов храма были созданы в 60-х годах 17 века костромскими и ярославскими мастерами и являются замечательным образцом монументальной резьбы того времени по дереву. Вообще, церковь Ильи Пророка дает наиболее полное представление об искусстве ярославских мастеров – строителей, резчиков, кузнецов, художников, многочисленны и ярославские изразцы, украшающие храм.
Церковь в плане имеет несимметричный вид, поэтому с каждой из четырех сторон выглядит по-новому. Меняются пропорции и взаиморасположение частей, остается только ощущение красоты и неповторимости.
Изначально при постройке храм Ильи Пророка стоял на подворье Скрипиных, но по утверждение генерального плана реконструкции Ярославля в 1778 году становится его центром, близ церкви располагаются административные городские здания.В 1920 году храм был закрыт, и в его стенах попеременно располагались запасники музеев, склады, даже шли разговоры об его сносе. В 30-х годах в храме открывается музей атеизма и устанавливается даже маятник Фуко. И только в 1989 году храм был освящен заново, но до сих пор не решен вопрос о его передаче Православной церкви полностью. Помещения храма по-прежнему занимает музей (филиал Ярославского художественно-исторического), и лишь по церковным праздникам в храме проходят торжественные службы.
